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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACGAGGGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTATTGTTTGTTTAATTTTTCTCTGATGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAACGAGGGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTATTGTTTATTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGGGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTGTTTATTTTTTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGAGGTACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTTTTTTGTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTGTTTGTTTATTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGGTGAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTTGTTTTGATCTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGAGGTGCAGATCAGTTCAGAGGATCGTGTCTATTTACATTATTTATTGTTTGTTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATAGTGTCTTGTTAGTTTGTTTATTCTATTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTCTCTCTCCAAAAAAATAAACAAAAAACAATGATCCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTTTGTTTTTCGTGCGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTCGTTTTTTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTTATATGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTATTCTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT23.37914e-06
AAACGAGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTCAGTTGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTCTTATGTTTATTTATGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAACGAGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGAGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTGTTTTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGGTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAACAATAAAGAATAAACATAAACATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGGTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATTTTTATTGTTTATTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGGTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGATTATGTTTTTTTGATTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTAACAGATCAGTTCAGCGGACGTGTCTTAAAATAAACAAAAACAATAAACAAAGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGAGTACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTGTTTATGTTTATTTCTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATATTTGATTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTATGTTATTTATCGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGAGTAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTTTGTATGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.