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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACGAGTCACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGGGGGGGAGGGAGGGAGGTGGTGGTGGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTTAATCTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGAGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTTTGTTTATTGTTTTTATTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGAGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGCCTTTTTTTATTAATTTATTATTTTATTTTGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAACGAGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTATTTTCTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTGTTTGTTTATTTTTTCTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCTTTGTTTATATTTATTTGTTGTTTGTTGATGCGGAATTCA11.68957e-06
AAACGAGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTGTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTTTTTGTTTATGTTATGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAACGAGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTTTTATTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTATTTATTTTTTGTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTTTGTTTATTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTAATTGTTTGTTTATTTATTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTCGTTGTTATTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTTTTTTTTCCGTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTAATAAATAAAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATGTTTATCTTTTTTTGTTGATGGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGAGTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTTCATTATTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTGACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATTTATTTTTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTTGTTTATTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTATATTTGTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTATTTGTTTATATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTGCCGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTTTGTTTGTTTATTTTTTTTGTAGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGAGTTACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATGAAAACAAAAATAAACAACAACAAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.