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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACGAGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGAGTCTTTATTGTATATTGTTTATTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATATTAGCTTTATTGTCGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTGTTTAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTAATTGTTTGTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTATTTGTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGAGTCTTATTTGTTAAATTGTTTATGTTTTGAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGAGTTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATAACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTTTTGTTTGTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATAAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATAAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTATTTTTGTTTGTTTATAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATAAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATCTTTTTTTGTCCTGTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATAAGCAGATCAGTTCAGGGATCGTGTCTTTGTTTGTTATTGTTTATTTATTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGATACACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATGTTTTTTTTTCAATTGTTGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAACGATACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATATTTTCTTTCATTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATACTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTTGTTTGTTGTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATAGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATTTAGTTTATTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATAGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTTTGTTTATTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATAGGCAGATCAGTTCAGCGATCGTGTCTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTATTTATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGATATCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTATTGTATAAATATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTATTATTTGTTGTTTATATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGATTATTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTATAAACAGTGATTTGTTTATAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATATTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTATTTGTTTATTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATCACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTATTTTTTGTATATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGATCACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTTATTGTTTGTTTATTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.