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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACGGTGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCTGTCTATTTGTTTATTTGTTTGTTTTGGATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGGTGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAACAAAAAAAATAAACAAAAACAAAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGGTGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTTTTGTTTATTTGTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGGTGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTCACCGCCCCCCCCACCCCCCGCGAGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGGTGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTATTGTTTACCAACAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGGTGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTACATTTTTTTTGTTTATTTATCGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGGTGTCCAGATCAGTTCAGCGGATGTGTCTTTTTGTTTATTTATTTTTGTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGGTGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTGTTTGTTTATCTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGGTGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTATTGTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGGTGTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTGTTGATGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGGTTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTACATTTTGTTTGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGGTTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTACTATTGCTTGTTTATTGTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGGTTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTTATTATTTTTGTTTGGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGGTTCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTAGTTTTTGTTTATAGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGGTTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATGTTTATTTTAGTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGGTTGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTGTTTTTTTTTTTTTGTTTTTGTTGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAACGGTTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTGTTTGTTTATTTTGTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGGTTTGCAGATCAGTTCAGCGATCGTGTCTTTTTGTTTACTGTTTTTGTTTATATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGGTTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTGTTTATTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTAACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTAATTTAATTTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTAACTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTGTTTATATTTCTAGTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTAAGTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTATTTTTATTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTAATCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTATATTTTATGTTTTGGTGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTACCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTATTTGTTTTTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTACGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGCCTTGTTTATTGTTTTTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.