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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAACGTACGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTGTTTTTTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTACTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGAATTTGATTGTTGATTGTTAGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTAGTTCAGATCAGTTCGCGGATCGTGTCTTTTATTTTTGTTTATTTCTGTTTATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGTATAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTATTGTTTATTTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTATCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTGTTTTTTGTTTATTGTGGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTATCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTGC11.68957e-06
AAACGTATTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAATAAACATACACAAAACAAACAACGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTCAAACAGATCAGTTCAGGATCGTGTCTAAATAAAAACAAACAAACAACGACAGATGCGGAATTCAGTGCA11.68957e-06
AAACGTCAAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATATTTTATTTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTCACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTGTTGTTTATGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTCACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTATTTACTTTTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTCAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTTGGTTTTATGTTTATATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGTCAGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTATTTTTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGTCAGGCAGATCAGTTCAGCGATCGTGTCTTGTTTTCATTTTGTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGTCAGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATGTATTTTTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTCAGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTGTTTATATTTAATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTCATCCAGATCAGTTCAGCGATCGTGTCTTGTTTATGTTTTGTTGTTTATATTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGTCATCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGCCTGTATGTTTATTGTTTTTTTTTTTTTTTGTTGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAACGTCATCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATAAACAACTTAATGTAAACATAAACGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTCATCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTGTTTATTTTTTTATTGATGCGAATTCAGTC11.68957e-06
AAACGTCATGCAGATCAGTTAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTGTTTATTTGTTTTGTTTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGTCATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGCGTTTGTTTATTGTTTATTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAACGTCCACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATAAACAAACATGAAACAATAAACAAGGTGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTCCACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTGTTTGTTTATTTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAACGTCCCCCAGATCAGTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.