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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAATCGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTATTGTTTATTTGTTTATATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATCGTCCCAGATCAGTTCAGCGGACGTGACTTTAATGATTGATGTTGAATATGTTTTGATGCGGAATTAAGAG11.68957e-06
AAAATCGTCTCAGATCAGTTCAGAGGATCGTGTCTTTAGTTTATTTATTAGTGTTTGTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATCTGAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATTAGATTATTTGTTTGTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATCTGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTGTTTATTTGTTTGTTTATTTTGGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATCTGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTATCGTTTGTTTTGTAAATATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAATCTTCACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTGTTTGTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGAACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTATTTATTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGACTACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTATTATATTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGAGCCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATAATAATAAACAATAAACAATACGGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAAATGATACCAGATCAGTTAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTTGAATATTTGATTATGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAATGCAAGCAGATCAGTTCAGCTGATCGTGTCTAGTGTATTTATTTTTTGATTTTTAAAGATCCATAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGCACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTGTTTATTTTTTGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGCACGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTGTTTATTTGTTTATTTATTTGTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGCCAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGGGTGGGGCGGCGCGGGGGAGAGGGGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAATGCCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTTTTTGGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGCCCCCAGATCAGTTCAGGGATCGTGTCTTTGTCTATTGTTTTTTATTTGTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAATGCCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTATTATTTTGTTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGCGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTATGTTTTGTTTATGTTTATGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGCGTACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTGTTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGCGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTTTTATTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGCTCCCAGATCAGTTCAGCGATCGTGTCTTGTTTATTTTTTTATTTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAATGCTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAACAAAAAACAAACAAACAAACAAGGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGCTTGCAGACCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATCGTATTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGGATTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTGTTTTGTTTATTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.