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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAATGGCAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTTCTTGTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGGCCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTTTTGCTTTTATTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGGCTACAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTGTATTTGTTTGTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGGCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTTATTATTTTTGTTTTGTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGGGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCAATCAAAAACAATAAACAAACAAAAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGGGATGGGGGGGGGGGGAGGAGGCGGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAATGGGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATGGTTTATTGTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGGTACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTGTTTTTTTATTGTTTATGGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGGTACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTTTGATTGTTTATAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGGTCGCAGATCAGTTCAGCGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTTTACGGTTTCGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAATGGTGCCAGATCAGTTAGCGGATCGTGTCTTGTATGTTTGTTTATTTTTTTTTATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAATGGTGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTTGTTTATTTATGTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAAATGGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTATTTATTTATTTTTGTTTATTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGGTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCGTTATTTGATTGTTTATTTTTTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGTAAAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTTTTGTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGTGCAACTGCAGCCG11.68957e-06
AAAATGTACCCAGATCAGTTCGCGGATCGTGTCTTATTTGTTTGTTTATTTAGGATTTTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAATGTACTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATGTTTATATTTATCTTTTATTGCTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGTAGGCAGACAGTTGCGGATCGTGTGTTTTGTATGTTTGATTATTTTGTTAGTGATGCGGAATTCAGTGCA11.68957e-06
AAAATGTCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTTTTATTTATTTATTGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAAATGTCCGCAGATCAGTTCAGGGATCGTGTCTGTTATTGTTTTTGTTTATTGTTTATCGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAATGTCTCCAGATCAGTTCAGCGGGATCGTGTCTTGTTTTTGTTTGTTTTGTAAGCAAATGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAAATGTGCTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTTTTTGTTTGTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGTTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTACTTTTTTTTGTTTATGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAATGTTCGCAGATCAGTTCGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTGTTGTTTATTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAATGTTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCGTTTTTGTTTTTTTTGTTTATTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.