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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Counts (Parquet) Attribution and checksum
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAATTGATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTTGTTTATTTGTTTATGTTGTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGCAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTCCCACCACATCGACTCCCCACCCCCTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGCATCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTGTTGTTGTTTTGATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTGTTTTGTATTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGCCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTGTTTATATTTGTTTATTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGCCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGGTTTTGGATTATTTGTTTGTTTTGGATGCAATTCAGTGC11.68957e-06
AAAATTGCTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTATTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGCTTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTACCCAAAAATAAACAAACAAACAAGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAATTGGATCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGGGTCTTTTGTTGATAATATAATGTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGGCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTGTTTATTTTTAGTGTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGGGCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGGTTTTGTTTTTTTTGCTTGTTTAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTATTTTTTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGGTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTTTTCTCTGTTTATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGTAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTCTTTGTTTATTTGTTTATATTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGTAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTGTTTATGTTTTTATTATTGATGAGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTGTTTGTTTGTTTGTTTATTTTTTTTGTTGATGCGGAATTCA11.68957e-06
AAAATTGTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTATTATTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGTGGCAGATCAGTTCAGCGATCGTGTCTATTTGTTTGTTTGTTTATTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAATTGTGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTTTTGTTTATTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTTCCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTGTTTTTATTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTTCGCAGATCAGTTCAGCGGATCTGTCTTTTTTTTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGTGCAACTGCAG11.68957e-06
AAAATTTCTCCAGATCAGTTCAGCGATCGTGTCTACAAAACAATAGATAAACATAAACAAGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAATTTCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATGTTCCGGATTTATAAACAGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTTGACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTTTTTTTTATTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.