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Source-file counts

Download and query reviewed source counts

Public manifest

These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.

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ERR11502318

DNAmutFOXR06

Reads
591,866
Distinct strings in file
587,130
File size
6.6 MiB
Source attribution · SHA-256
Source project:
PRJEB62756
Archive record:
ERR11502318
Sample:
SAMEA113565960
SHA-256
f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3

Exact read query

Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.

SequenceCountRead fraction
AAAATGTTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTATTTGTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGTTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGATTACGCCATTCGATGATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATGTTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTAAACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAACAAAAAAAAAAACAACAAACAAAGGATGCGGAATTCAG11.68957e-06
AAAATTACTGCAGATCAGTTCAGAGGATCGTGTCTTGTTAGTTTGTTAATATTACATTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTAGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTAATTTTTCTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTATCTCAGATCAGTTCAGCGGATGTGTCTAAAAAGTAAACAAACAAACAATAAGAGATGCGGAATTCAGTA11.68957e-06
AAAATTCAACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTATTTAAGTTTGATTGATGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTCACTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAACCAAAATAAATAAACAAAGAATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTCATCCAGATCAGTTCAGCGGTCGTGTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGATGCGGAATTCAGTGC11.68957e-06
AAAATTCATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATGTTTATTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGAG11.68957e-06
AAAATTCATGCAGATCTGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTATTGTTTATTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTCATTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTAGTTTATTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG11.68957e-06
AAAATTCCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTTATTGAATAAATATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTCGACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTAGTTTGTTTATTTTTTTTTATTGATGCGGAGTGCAGG11.68957e-06
AAAATTCGACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTTGTTTGTTTATTTTTTTTTATTGATGCGGCATGCAGG11.68957e-06
AAAATTCGACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTATTTTTGTTTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTCGAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTTTTTTTTTTTTGTTATTGATGGGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTCGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTATTGTTTGTTTATTTTTTCGTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTCTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTCAGTTTGTTTATGTTTATCTTTTCCGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTCTTCCAGATCAGTTCAGAGGATCGTGACATGTTAGTTTGTTTGTTTATTTTTATTGATGAGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTCTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTATACATTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAGACAATAAACAATAACAAAAACAACGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06
AAAATTGATCCAGATCAGTTCACGATGTGTCTTTGTTTATTTTTGTTTGTTTATTTTTGATGCGGAATTCAGTGCA11.68957e-06
AAAATTGATCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATATTTATTATTTAATGTTGATGCGGAATTCAGT11.68957e-06

Read fractions use all reads in this source file as the denominator.