These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.
ERR11502318
DNAmutFOXR06
- Reads
- 591,866
- Distinct strings in file
- 587,130
- File size
- 6.6 MiB
Source attribution · SHA-256
- Source project:
- PRJEB62756
- Archive record:
- ERR11502318
- Sample:
- SAMEA113565960
- SHA-256
- f3db902fd5b7b66a0851e57eb988d6e5da1b47fe21062f675d2d3a1dd1c8b6b3
Exact read query
Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.
| Sequence | Count | Read fraction |
|---|---|---|
| AAAATGTTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTATTTGTTTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATGTTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGATTACGCCATTCGATGATTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATGTTTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATTTGTTTTTGTTTGTTTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTAAACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAACAAAAAAAAAAACAACAAACAAAGGATGCGGAATTCAG | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTACTGCAGATCAGTTCAGAGGATCGTGTCTTGTTAGTTTGTTAATATTACATTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTAGGGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTGTTTAATTTTTCTTTGTTTGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTATCTCAGATCAGTTCAGCGGATGTGTCTAAAAAGTAAACAAACAAACAATAAGAGATGCGGAATTCAGTA | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTCAACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTATTATTTAAGTTTGATTGATGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTCACTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAAACCAAAATAAATAAACAAAGAATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTCATCCAGATCAGTTCAGCGGTCGTGTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGATGCGGAATTCAGTGC | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTCATGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTATGTTTATTTGTTTATTGTTGATGCGGAATTCAGAG | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTCATGCAGATCTGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTTTGTTTATTGTTTATTTTTTATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTCATTCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTGTTAGTTTATTTTTTTGTTGATGCGGAATTCAGTG | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTCCTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATTTTATTGAATAAATATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTCGACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTAGTTTGTTTATTTTTTTTTATTGATGCGGAGTGCAGG | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTCGACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTATTTTGTTTGTTTATTTTTTTTTATTGATGCGGCATGCAGG | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTCGACCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTATTTATTTTTGTTTTTTTTTGTTTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTCGAGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTGTTTGTTTTTTTTTTTTTTGTTATTGATGGGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTCGTGCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTATTGTTTGTTTATTTTTTCGTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTCTCCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTCAGTTTGTTTATGTTTATCTTTTCCGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTCTTCCAGATCAGTTCAGAGGATCGTGACATGTTAGTTTGTTTGTTTATTTTTATTGATGAGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTCTTCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTATACATTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTGACCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTAGACAATAAACAATAACAAAAACAACGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTGATCCAGATCAGTTCACGATGTGTCTTTGTTTATTTTTGTTTGTTTATTTTTGATGCGGAATTCAGTGCA | 1 | 1.68957e-06 |
| AAAATTGATCCAGATCAGTTCAGCGGATCGTGTCTTTTGTTTATATTTATTATTTAATGTTGATGCGGAATTCAGT | 1 | 1.68957e-06 |
Read fractions use all reads in this source file as the denominator.