These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.
ERR8016766
NACC1_CC40NTGAGTAYWCA3
- Reads
- 447,391
- Distinct strings in file
- 438,015
- File size
- 5.3 MiB
Source attribution · SHA-256
- Source project:
- PRJEB49150
- Archive record:
- ERR8016766
- Sample:
- SAMEA12312951
- SHA-256
- 4d4e59719af036199a7d44bece9d5c89229d3ab700e97dd0c37b5e2ac221912d
Exact read query
Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.
| Sequence | Count | Read fraction |
|---|---|---|
| AACATGGGTCATACATGTAGCTGAACGTAACGTTCGGGTG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGGTCATATATGATTAGCATGTGTGGTGTTGTATG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGGTGAGTGAGTCGGCTCGATGATGTGTGGGGGTA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGGTGCGTGTTATTAGCATGATCAAGGGGAGATCA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGGTGCTGCTGCGTGTTGAAACCAGGGTGCAGACG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGGTGGGGAGTGTAAAGACGCATGTAAGGGCATGG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGGTGTACTGAGCAGGATGTCTACAGGTTGCATGA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGGTGTACTGGTCGGACTAAAGGGATTTTGCATGG | 2 | 4.47036e-06 |
| AACATGGGTGTAGTGTGTTGGGCACATGATTATGGGGTAG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGGTGTGCAGGTGTTAACATGGTAGTAATGCGCGT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGGTGTGCGGTATGTATGGTATGTTGCGTGTTTGT | 2 | 4.47036e-06 |
| AACATGGGTGTGCTCAGGCGTGAGCTATACATGCATCGAG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGGTGTTGCTGGGTGCATACAGTGGCACATGGGAA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGGTTACGCGTATGCATGTGTCTGGGTCGACATGT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGGTTATAGTAGCAAGCTTGGTGTATATAGTGCAT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGGTTCACGCCGTACGGGATTAGCGCGCACATGTA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGGTTGGCATGGATGCGGGTAGAACGTCATGGGTG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTAAGCTAGCGATTGCCAAAGGGTCACATGTATG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTAAGGCAGACCGGCGATTCGCATAGGCACTGCA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTAAGTCAATATCGTCGTCATGTAGTGGCATGTA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTACACGGCCCCTCATACGTGGCAGATGGCGGAT | 2 | 4.47036e-06 |
| AACATGGTACATATGGATGTCGGCCCGTGTTTTGAGGACG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTACATGCTAAGGACCCATGGTGGTCGTATTGCG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTACCGACATGCCTTTGTGGGTGCACGGGGTGCA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTACTATGCCGTAGTGTGTTATGTGCAGATGGTA | 1 | 2.23518e-06 |
Read fractions use all reads in this source file as the denominator.