These collections primarily describe transcription-factor–DNA binding. They include source-reported controls and constructs; file totals are not target or validated aptamer totals.
ERR8016766
NACC1_CC40NTGAGTAYWCA3
- Reads
- 447,391
- Distinct strings in file
- 438,015
- File size
- 5.3 MiB
Source attribution · SHA-256
- Source project:
- PRJEB49150
- Archive record:
- ERR8016766
- Sample:
- SAMEA12312951
- SHA-256
- 4d4e59719af036199a7d44bece9d5c89229d3ab700e97dd0c37b5e2ac221912d
Exact read query
Queries are case-sensitive. No trimming or reverse-complement merging is applied.
| Sequence | Count | Read fraction |
|---|---|---|
| AACATGGTAGAACACGCATGGGTCAGGTAGCGCGGCTGGG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTAGCGCGACATGGGGCTCCTTTCAACATGTGTG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTAGTGCATGCATACCAGCTGCGCGCGTTATCTA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTATCGAGAGGACTGGTCACCCCAATCAGTAGCG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTATCTAACAATTGGTGACAGGATCTCGTACATG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTATGGCACGAATGTGGTAAGCTGCATGAGCTTT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTCCAAGTACGGGACGAGCATGCACGAGTTGTCT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTCCGGCACGGGTTCATGGGAGGACGGGATGTCC | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTCCGGTCACGGATGTCGAACACGGTACGGAGTC | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTCGATATGTAATAGGCATGGCAACACGCGTGAT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTCGGGGGCGTAAGGTAGCGTGTTCATGTATGGT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTCTTTATGTGAATTACACAGGCCACGTGTTAGG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTGATACAGGTAGAAAACACGGATGACACCTACA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTGATGATCCTGTTGTCATACGTGTTCTCGTGTA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTGGTTACATATGTCATTCGTTGCGATAACCGTA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTGTAACGCATGCGTGTTGGTCGCATGGTATTGA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTGTGTAAGGTTACGTGCATGCATGTCTTGAGTA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTTAGACTATGTCGGTGTATACATGATGGTTGAG | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTTAGGATGCCCCAGACAGTGCCATGTTTACGTA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTTAGGTGTGTGGTTTTTCAGTTGACATGTAACC | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTTAGTGCATGGCAGGCCGTGTGAGGTGTGTACT | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTTAGTGCTGTGGCCAGCACGTGGTGGTTTTGTA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTTATCAGGCTCTTGTATGTTACTTTTTTGAGTA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTTATCCCACGCGTGTCCATGTGGCCAATTGTTA | 1 | 2.23518e-06 |
| AACATGGTTGGGTATTCGCATGTATAAGGTGTCTGGCGCA | 1 | 2.23518e-06 |
Read fractions use all reads in this source file as the denominator.